Construiu uma cela no fundo do quintal da casa dos pais e começou uma vida religiosa. Seu tempo livre era dedicado ao recolhimento, oração e meditação dos evangelhos. No seu intimo na cela, costumava usar uma coroa de espinhos para se lembrar sempre da paixão de Cristo. Seu amor para com os desvalidos da vida em especial aos índios e negros foi exemplar. A mística de Rosa ia além do comum, principalmente diante do santíssimo sacramento. Mas a cruz nunca deixou Rosa Maria se separar da paixão de Cristo. Teve perseguições e incompreensões.

No final da vida, passava sofrimentos físicos com dores extremas junto a uma doença prolongada. Quando Rosa Maria sentia dores dizia " senhor, fazei-me sofrer mais, contanto que aumentais meu amor para convosco. Entre suas penitências estava o jejum contínuo. Comia muito pouco, o mínimo necessário, unicamente para sobreviver e bebia pouca água. Dormia sobre duas tábuas e sempre dizia " senhor, sua cruz e muito mais cruel que a minha”.

Em 24 de agosto de 1611, com 31 anos, Rosa Maria alçou voo para a ressurreição e para a vida eterna. Após sua morte muitos milagres foram alcançados pelos seus devotos fieis. Rosa Maria foi beatificada pelo papa clemente x em 1667 e sua canonização foi proclamada pelo papa clemente x em 1571, como primeira santa e padroeira da américa latina e das Filipinas. Disse clemente x na bula de canonização " não podia faltar à cidade dos reis (como costuma chamar-se lima) a estrela própria, que conduzisse a Cristo, senhor e rei dos reis.